隨著年齡增長膠原蛋白逐漸流失、皮下組織脂肪層也開始變得鬆弛、欠缺彈性，當毛孔之間的張力減小便會形成粗大毛孔。

另一常見原因是由於肌膚重覆地受到擠壓，使毛孔周邊的膠原蛋白受破壞，使毛孔失去支撐而變得粗大。

此外，嚴重暗瘡或皮膚受傷時，由於皮膚真皮層膠原蛋白受破壞，也有機會形成凹凸疤痕(凹凸洞)。

要改善凹凸洞疤痕和粗大毛孔，需由皮膚底層的膠原蛋白著手，剌激纖維母細胞製造新的膠原蛋白(骨膠原) 。